Los programas de evaluación de la investigación tienen como objetivo general la excelencia en las actividades de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica en el ámbito de las Universidades y de los centros de investigación.
En la actual programación anual de actuaciones están activos los siguientes programas en este ámbito:
Para desarrollar estos programas, ACSUCYL cuenta con una Comisión de Evaluación de la Investigación .